南山区东部的南山博物馆坐落在华侨城内，是一座以本土文化为主题的综合性博物馆。馆内陈列着以南山本土文化和深圳、珠三角地区古代文化为主，集中展示了丰富多彩的史前文化、传统手工艺、客家文化、海洋文化等等精彩的文化遗产。其中以红色文化、反映深圳、珠三角地区现代工业等内容的专题展览最为引人关注。
南山博物馆园林建筑也是一大亮点。博物馆前庭广场是世界上2个使用彩色徐岩人物深浮雕艺术进行园林景观设计的场所之一，在雕塑和园林中相互呼应，更为整座博物馆增添了震撼力。博物馆内部风格前卫，又有现代感，和规范的艺术展览介绍和配套的科技互动设备，让观众不仅可以深入了解到南山别具特色的历史和文化，并且有更为丰富、多样和趣味的参观感受。南山博物馆的开放时间为周二至周日上午9：00 -- 12：00，下午13：30 — 17：00，建议游客提前预约。